"Magical Girl" xoay quanh Kana Sakuragi, một nữ sinh đại học đang gặp khó khăn trong việc tìm kiếm việc làm. Cuộc đời của Kana bước sang một trang mới khi cô được nhận vào một công ty khởi nghiệp chuyên về những cô gái phép thuật, với mục tiêu tiêu diệt một loại thảm họa thiên nhiên mang tên "Kaii." Từ đây, Kana bắt đầu cuộc sống làm việc đầy thử thách và bất ngờ, nơi cô và những đồng nghiệp của mình phải đối mặt với những hiểm nguy từ Kaii, đồng thời khám phá sức mạnh phép thuật tiềm ẩn bên trong bản thân. Cuộc sống mới của Kana mang đến cho cô không chỉ những nhiệm vụ khó khăn mà còn cả những tình bạn và trải nghiệm quý giá.
